Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP28Q4G0W2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms