Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SP6Q3SY56 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SP6Q3SY56 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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