Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q1T7F1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
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