Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SYT16Q17RD7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYT16Q17RD7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms