Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UPP1Q16831 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms