Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CLPPQ16740 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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