Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PDK4Q16654 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDK4Q16654 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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