Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNA2Q15822 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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