Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIX1Q15475 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms