Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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SYCP1Q15431 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SYCP1Q15431 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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SYCP1Q15431 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYCP1Q15431 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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