Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRRQ15256 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRRQ15256 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRRQ15256 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRRQ15256 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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