Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GAPVD1Q14C86 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GAPVD1Q14C86 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms