Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
EBI3Q14213 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
EBI3Q14213 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms