Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBFBQ13951 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms