Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RUNX3Q13761 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RUNX3Q13761 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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