Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKD2Q13563 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
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