Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TCIRG1Q13488 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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TCIRG1Q13488 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TCIRG1Q13488 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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