Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC005324.2-201ENST00000433051 415 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZNF30-AS1-201ENST00000604333 625 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MKRN4PQ13434 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms