Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 COX4I1-207ENST00000564648 1235 ntTSL 59.88□□□□□ -0.832e-16■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.884e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 KRTCAP2-205ENST00000482246 414 ntTSL 319.16■□□□□ 0.664e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 KRTCAP2-204ENST00000471891 578 ntTSL 314.59□□□□□ -0.074e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 KRTCAP2-210ENST00000497317 477 ntTSL 314.01□□□□□ -0.174e-7■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 KRTCAP2-208ENST00000491084 598 ntTSL 313.04□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 KRTCAP2-207ENST00000490672 3264 ntTSL 212.8□□□□□ -0.364e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 KRTCAP2-202ENST00000461136 271 ntTSL 35.26□□□□□ -1.574e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 EIF3G-207ENST00000589009 1522 ntTSL 218.27■□□□□ 0.519e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 EIF3G-214ENST00000593066 590 ntTSL 514.62□□□□□ -0.079e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.034e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.594e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-8■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.211e-11■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 MMS19-218ENST00000485400 1513 ntTSL 217.67■□□□□ 0.421e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.311e-11■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 C19orf48-203ENST00000593287 578 ntTSL 516.19■□□□□ 0.181e-11■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 MRPL38-217ENST00000588620 498 ntTSL 315.47■□□□□ 0.074e-22■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-11■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 MMS19-219ENST00000495415 1879 ntTSL 515.19■□□□□ 0.021e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 C19orf48-213ENST00000601267 782 ntTSL 215.13■□□□□ 0.011e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 C19orf48-208ENST00000597493 971 ntTSL 214.88□□□□□ -0.031e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 C19orf48-211ENST00000599004 866 ntTSL 514.84□□□□□ -0.031e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 C19orf48-215ENST00000641539 717 nt14.84□□□□□ -0.031e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 DERL1-202ENST00000405944 1994 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-11■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 C19orf48-205ENST00000596287 827 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-11■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 DERL1-206ENST00000524119 5513 ntTSL 412.34□□□□□ -0.431e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.511e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-11■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.611e-11■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 ARPC2-216ENST00000487321 550 ntTSL 27.81□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.224e-7■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -02e-8■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.23e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 UQCRQ-206ENST00000498309 874 ntTSL 218.77■□□□□ 0.63e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.343e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 UQCRQ-202ENST00000378667 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.493e-9■■□□□ 12.9
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PABPC4Q13310 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.052e-32■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 CANX-207ENST00000503303 345 ntTSL 59.72□□□□□ -0.852e-32■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.991e-323■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.741e-323■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-323■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 HNRNPD-211ENST00000514671 1089 ntTSL 59.49□□□□□ -0.891e-323■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 HNRNPD-210ENST00000514325 4597 ntTSL 1 (best)5.06□□□□□ -1.61e-323■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMEM164-206ENST00000464177 761 ntTSL 515.39■□□□□ 0.054e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.224e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.294e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.444e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PIEZO1-214ENST00000521877 686 ntTSL 221.29■■□□□ 18e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PIEZO1-213ENST00000518793 660 ntTSL 314.54□□□□□ -0.088e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.234e-6■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.422e-11■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.669e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.629e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.399e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.646e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.356e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MRPS22-214ENST00000498505 1401 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.146e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MRPS22-207ENST00000480938 1774 ntTSL 212.76□□□□□ -0.376e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 MRPS22-211ENST00000492644 2160 ntTSL 1 (best)7.86□□□□□ -1.156e-7■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.893e-8■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 RPL27A-208ENST00000530913 805 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-33■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 DHX9-202ENST00000473076 1378 ntTSL 1 (best)15.65■□□□□ 0.14e-9■■□□□ 12.9
PABPC4Q13310 DHX9-207ENST00000485081 2531 ntTSL 212.39□□□□□ -0.434e-9■■□□□ 12.9
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