Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CALCOCO2Q13137 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CALCOCO2Q13137 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CALCOCO2Q13137 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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CALCOCO2Q13137 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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CALCOCO2Q13137 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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CALCOCO2Q13137 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CALCOCO2Q13137 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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