Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
DUSP4Q13115 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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