Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTP4A2Q12974 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTP4A2Q12974 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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