Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPN13Q12923 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPN13Q12923 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PTPN13Q12923 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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