Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMARCB1Q12824 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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