Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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KCNMA1Q12791 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
KCNMA1Q12791 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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