Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGEF5Q12774 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms