Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CACNG1Q06432 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms