Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNAP25P60880 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms