Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC00313P59037 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms