Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MTTPP55157 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTTPP55157 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MTTPP55157 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTTPP55157 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTTPP55157 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms