Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AQP4P55087 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AQP4P55087 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AQP4P55087 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AQP4P55087 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AQP4P55087 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AQP4P55087 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AQP4P55087 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms