Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP12AP54707 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms