Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR4P51679 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR4P51679 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR4P51679 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR4P51679 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR4P51679 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR4P51679 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms