Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPIAP49247 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPIAP49247 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RPIAP49247 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPIAP49247 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPIAP49247 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPIAP49247 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
RPIAP49247 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPIAP49247 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPIAP49247 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPIAP49247 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms