Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTDSS1P48651 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms