Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABRA4P48169 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms