Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPZBP47756 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPZBP47756 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPZBP47756 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPZBP47756 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPZBP47756 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CAPZBP47756 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms