Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNPDA1P46926 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNPDA1P46926 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms