Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMPOP42166 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMPOP42166 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMPOP42166 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMPOP42166 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms