Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ETFBP38117 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ETFBP38117 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms