Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CHRNA7P36544 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms