Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATP6V1E1P36543 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms