Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ACTN2P35609 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTN2P35609 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms