Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHC1P29353 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHC1P29353 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHC1P29353 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHC1P29353 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHC1P29353 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHC1P29353 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHC1P29353 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SHC1P29353 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms