Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2E2P29084 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms