Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRPH2P23942 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms