Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PTPREP23469 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPREP23469 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPREP23469 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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