Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA1P20827 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA1P20827 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms