Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NME1P15531 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NME1P15531 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME1P15531 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NME1P15531 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME1P15531 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME1P15531 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NME1P15531 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms