Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HPGDP15428 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms